SILAC定量蛋白质组
2002年，丹麦Mann实验室的OngSE等对AACT技术作了进一步改进，建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究，为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。
iTRAQ同位素标记差异蛋白分析技术
iTRAQ技术（同位素相对标记与绝对定量技术）是目前进行蛋白质组研究的最新技术,可以一次实现上千种蛋白质的分离和鉴定，具有定量效果好、重复性好等多种优点。
染色质免疫共沉淀测序（ChIP seq）
ChIP与下一代高通量测序技术相结合的ChIP-seq技术具有成本低、效率高、检测的灵敏度和覆盖度高等优势,已经成为这一领域的首选技术。
大肠杆菌的蛋白表达和纯化
义翘神州开发出多种宿主系统，能在大肠杆菌中表达蛋白。通常采用可溶性表达以及包涵体表达系统来表达各种不能糖基化的蛋白质，可以制备克到千克级的可溶性蛋白。